Siga o tutorial anterior de simulação

Crie um arquivo de texto job.txt com um comando por linha:

• gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -r em.gro -p topol.top -n index.ndx -o nvt.tpr​

• gmx mdrun -deffnm nvt

• gmx grompp -f npt.mdp -c nvt.gro -t nvt.cpt -r nvt.gro -p topol.top -n index.nd -o npt.tpr

• gmx mdrun -deffnm npt

• gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt - topol.top -n -index.ndx -o md_0_10.tpr

• gmx mdrun -deffnm md_0_10

Entre no GridMarkets e selecione o job.txt como arquivo do programa na seção do GROMACS

• Esse é a única parte paga​

• Cada hora da máquina virtual, é cerca de 2 dólares

• Uma simulação de 50 ns demorou cerca de 22 horas

• Se quiser, pode rodar no seu computador gratuitamente, mas irá demorar consideravelmente mais, especialmente se a sua simulação for longa